Photoshop追記

光軸のズレも自動で修正できることに気づいた.
合成を実行する前に,すべてのレイヤーを選択して,
編集→レイヤーを自動整列
をすればよい.めでたし.めでたし.

まとめると,
Photoshop CS4 for Mac 焦点合成の手順メモ.
1.開く
 ファイル→スクリプト→ファイルをレイヤーとして読み込み
 合成する写真のファイルを選択
 レイヤーを読み込むでファイルを確認してOK
2.ズレの修正(実体鏡の場合のみ)
 実体顕微鏡で撮影した写真は光軸のズレ(左右に画像が移動する)を修正する手順.
 選択範囲→すべてのレイヤー
 編集→レイヤーを自動整列
3.合成を実行
 編集→レイヤーを自動合成→画像をスタックを選択(シームレスなトーンとカラーをチェック)
4.最後にレイヤーを統合して1枚の画像に仕上げる.これをしないと個々のレイヤーが残ってしまう.
以上で完了.